oefening isolation (glm)

Bij de oefening 8 van glm over isolation wordt er een ANOVA gedaan van het model zonder interactie tov het model waar de area uit gelaten werd. Daarna doen ze een ANOVA van het model zonder interactie tov het model waar de isolation uit gelaten werd. Wat is hier het nut van en wat kan je hier uit afleiden?

dat is da likelihood ding, zo testen die de significantie van het effect van area en plaats, om te beurten.
alleen dacht ik da ge da bij glm ook gewoon kon vinden door anova(glm) te doen, maar daar twijfel ik nu aan..

Helena Nelissen schreef:dat is da likelihood ding, zo testen die de significantie van het effect van area en plaats, om te beurten.
alleen dacht ik da ge da bij glm ook gewoon kon vinden door anova(glm) te doen, maar daar twijfel ik nu aan..

Wat bedoel je met likelihood ding?
Dit geeft R:

anova(glm5b,glm5c)
Analysis of Deviance Table

Model 1: incidence ~ area + isolation
Model 2: incidence ~ isolation
Resid. Df Resid. Dev Df Deviance
1 47 28.402
2 48 36.640 -1 -8.238
> anova(glm5b,glm5d)
Analysis of Deviance Table

Model 1: incidence ~ area + isolation
Model 2: incidence ~ area
Resid. Df Resid. Dev Df Deviance
1 47 28.402
2 48 50.172 -1 -21.770

Ik heb nog altijd niet door naar welke getallen je hier moet kijken en wat je hier moet uit afleiden. Als je een summary doet, weet toch al genoeg (opp heeft een positief effect en isolatie heeft een negatief effect)?

die anova van die 2 modellen is een likelihoodratio ding: daar wordt vergeleken wat het beste model is: als de p waarde kleiner is dan 0,05 is het gereduceerde model het beste (dus hetgene zonder area of isolation)
om de p waarde te vinden moet je de onderste rij getallen gebruiken:
Resid. Df Resid. Dev Df Deviance
1 47 28.402
2 48 36.640 -1 -8.238
in R: pchisq(36.640,48,lower.tail=F)
= 0,884 --> groter dan 0,05 --> model glm5b is beter dan 5c --> area heeft een significant effect
en dan doe je hetzelfde voor isolation.

maar deze techniek wordt normaal gebruikt om te testen of dingen significant zijn bij de lmer functie.
veel succes morgen!

Ah ok, merci
Voor u ook veel succes.